清代戏曲家孔尚任的《桃花扇》以秦淮河为背景
明朝时代,秦淮河畔人烟稠密,金粉楼台,十分繁华。秦淮河畔的夫子庙、贡院是封建统治者笼络和挑选人才的地方。明代吴敬梓的小说《儒林外史》中,对此有深刻的揭露。清代戏曲家孔尚任的《桃花扇》以秦淮河为背景,歌颂了歌妓李香君的高尚情操,揭露了统治阶级内部的矛盾和腐败,描写了国破家亡的历史悲剧。
新中国建立以后,人民政府对秦淮河大力疏浚。在1976年至1980年间,又开了一条秦淮新河,这是秦淮河的一次大改变。新河自江宁县小龙圩,经雨花区铁心桥、西善桥,直至双闸金胜村,全长18公里,河宽130—200米不等,可行洪800秒立米。新河上架公路桥五座,农便桥四座,铁路桥一座,水利枢纽一套,大大提高了秦淮河泄洪抗旱能力,对促进农业生产、保障城市建设发挥了巨大作用。