聚宝门建有门垣四重,内瓮城三座,设有“瓮洞”(今人所称“藏兵洞”)27个。其中,第一道城门左右各3个,城门上的楼基中共设7个,均坐南朝北,以城基中洞为最大,面积达310平方米。东西马道下面各设坐西向东和坐东向西的藏兵洞7个。这27个藏兵洞大小不一,平时作储藏守城器械和军用物资,战时藏兵,相传可藏兵3000余人。
通济、聚宝、三山等城门是明代南京最大的3座内瓮城,只可惜通济、三山的内瓮城已与城门一同被拆毁,消逝在历史的烟尘中,我们只能从保留下来的照片上一睹其风采。
聚宝门之结构式样及构筑手段,特别是藏兵洞这一创造性设施,充分显示了明代在筑城设防上的成熟与完善,它是中国古代城垣建筑史上的一朵奇葩。